Создан 15 мая 1997 года постановлением правительства Республики Саха (Якутия).

«Усть-Вилюйский» расположен на территории Кобяйского улуса, в местности, называемой Сорок островов. Отличается обилием островов, ихтио- и орнитофауны, особенно водоплавающих птиц. Природа парка, благодаря разнообразию ландшафта, исключительно живописна, животный и растительный мир богат и разнообразен. Здесь обитают 26 видов рыб, 2 вида земноводных, 1 вид рептилий, 163 вида птиц (125 видов гнездящихся), 37 видов млекопитающих. Значительный элемент в фауне региона составляют редкие и охраняемые виды, занесённые в Красную книгу России и Якутии.

На территории природного парка есть три кордона. Кордон «Лямпушка» расположен в 125 км от поселка Сангар, кордон «Курапашкалах» — в 160 км, кордон «Тунгус-Хая» — в 175 км.